據財政部官網消息，中央財政2016年撥付專項資金338億元用于治理水、土、氣。
在水污染防治方面，2016年，中央財政共撥付專項資金131億元，對納入中央儲備庫的重點流域水污染防治等項目予以支持。
土壤污染防治，也是中央財政支持的重點。2016年，根據國務院印發的《土壤污染防治行動計劃》，中央財政整合原重金屬污染防治專項等設立土壤污染防治專項資金，當年撥付專項資金95億元，重點支持38個重金屬污染重點防控區域治理示范延續工作；支持各省負責統籌用于土壤污染風險管控、監測評估、監督管理、污染土壤修復與治理等；支持土壤污染狀況詳查工作。
根據《大氣污染防治行動計劃》，從2013年開始，中央財政設立大氣污染防治專項資金，“十二五”期間共安排254億元，支持京津冀及周邊、長三角、珠三角治理霧霾。2016年下達專項資金112億元，支持京津冀、長三角、珠三角等重點區域落實“大氣十條”。同時，建立專項資金績效評價制度，將資金安排與環境質量改善績效考核結果掛鉤。
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